91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3071 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  43.08 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  41.08 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  45.38 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  39.15 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  59.62 
 
 		 214 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  30.83 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  44.78 
 
 		 218 aa  62  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  48.53 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  50.94 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  34.58 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  51.92 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  51.92 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  44.78 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  44.12 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  44.16 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  30.16 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  30.83 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  48.08 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  41.89 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  38.95 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  48.39 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  43.75 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  49.09 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  51.92 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  44.62 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  39.47 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  44.23 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  46.15 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  46.15 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  51.92 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  46.15 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  43.28 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  29.2 
 
 		 122 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  25.89 
 
 		 123 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  40.28 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  42.19 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  46.15 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  40.3 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  45.07 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  45 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  25.44 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  37.5 
 
 		 148 aa  48.9  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  38.46 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10047  hypothetical protein  45.9 
 
 		 289 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  30.39 
 
 		 116 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  30.39 
 
 		 116 aa  47.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  42.31 
 
 		 231 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  46.15 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  28.3 
 
 		 113 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  46.15 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  38.1 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  46.48 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  44.23 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  31.4 
 
 		 130 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  36.54 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  44.23 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  43.75 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  38.46 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  42.42 
 
 		 248 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  40.32 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  44.23 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  33.08 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0214  hypothetical protein  28.07 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  41.51 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  38.46 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  28.86 
 
 		 128 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  42.31 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  38.46 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17320  hypothetical protein  31.75 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.755634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  39.06 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  44.23 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1684  hypothetical protein  24.72 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.43716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0292  conserved hypothetical protein-like protein  30 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  44.23 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4063  protein of unknown function DUF1707  33.01 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  26.55 
 
 		 122 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5750  hypothetical protein  38.71 
 
 		 292 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5463  hypothetical protein  38.71 
 
 		 292 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0317126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5374  hypothetical protein  38.71 
 
 		 292 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50658  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  45.1 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  42.31 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  44.23 
 
 		 198 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>