73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2279 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  342  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  53.42 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  49.32 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  47.62 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  47.5 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  50.88 
 
 
231 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  48.61 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  52.38 
 
 
191 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  58.49 
 
 
146 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  51.79 
 
 
218 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  50 
 
 
200 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  38.04 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  45.21 
 
 
248 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  30.82 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  50.82 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  46.48 
 
 
214 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  44.83 
 
 
190 aa  55.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  35.23 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  46.67 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  43.55 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  48.21 
 
 
215 aa  54.7  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  49.12 
 
 
211 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  51.79 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  50.88 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  39.73 
 
 
213 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  40 
 
 
166 aa  51.2  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  48.08 
 
 
154 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  48.28 
 
 
186 aa  50.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  35.44 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  47.37 
 
 
234 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  43.84 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  44.83 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  47.27 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  41.07 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  40.96 
 
 
206 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  46.88 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  51.92 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  39.08 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  41.38 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  40.79 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  41.38 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  39.71 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  40.79 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  41.38 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  47.54 
 
 
147 aa  48.5  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  40.79 
 
 
197 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  43.4 
 
 
157 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  46.67 
 
 
217 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  48.28 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  43.08 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  45.76 
 
 
206 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  48.28 
 
 
276 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  41.51 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  40.98 
 
 
229 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  43.1 
 
 
227 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  41.67 
 
 
187 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  40.38 
 
 
181 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  41.82 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  42.62 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  37.8 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  41.38 
 
 
148 aa  45.4  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4063  protein of unknown function DUF1707  52.27 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  48.08 
 
 
208 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  41.43 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  39.62 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  39.62 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  46.15 
 
 
245 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  40.74 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>