71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4611 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  300  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  60 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  64.81 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  46.59 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  54.41 
 
 
157 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  56.45 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  53.45 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
217 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  52.63 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  47.14 
 
 
206 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  49.09 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  43.66 
 
 
214 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  38.96 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  46.77 
 
 
204 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  54.24 
 
 
206 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  32.11 
 
 
219 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  49.18 
 
 
206 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  50 
 
 
130 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  48.28 
 
 
194 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  45.45 
 
 
215 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  47.27 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  46.3 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  43.33 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  48.21 
 
 
147 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  46.43 
 
 
211 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  38.71 
 
 
219 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  40.74 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  45 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  53.23 
 
 
242 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  46.15 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  40.54 
 
 
191 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 
231 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  33.87 
 
 
181 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  46.15 
 
 
209 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  46.55 
 
 
148 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  55.77 
 
 
215 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  37.5 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  42.59 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  38.81 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  49.06 
 
 
227 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  46.15 
 
 
229 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 
213 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  38.81 
 
 
190 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  36.14 
 
 
217 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  41.51 
 
 
200 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  39.02 
 
 
180 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  43.64 
 
 
248 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  43.4 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  43.4 
 
 
197 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  43.4 
 
 
197 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  56.25 
 
 
219 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4063  protein of unknown function DUF1707  53.33 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  43.4 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  43.4 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  35.85 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  42.11 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  40.3 
 
 
175 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  46.15 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  32.43 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  44.23 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  37.66 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  37.74 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  39.62 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  39.62 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  39.62 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  42.59 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  39.34 
 
 
206 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  35.94 
 
 
161 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  33.96 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>