87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2419 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 
190 aa  373  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  44.44 
 
 
197 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  35.45 
 
 
200 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  32.83 
 
 
219 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  33.52 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  32.97 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  35.87 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  30.26 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  32.97 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  32.97 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  32.97 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  30.53 
 
 
214 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  32.42 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  30.88 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  31.49 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  30.22 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  34.91 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  32.8 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  28.9 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  31.89 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  34.19 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  34.81 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  32.46 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  30.21 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  30.21 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  30.39 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  31.41 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  30.21 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  32.39 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  37.98 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  31.45 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  30.1 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  31.96 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  30.19 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  31.69 
 
 
198 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  27.53 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  32.8 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  49.18 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  28.42 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  30.98 
 
 
230 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  53.45 
 
 
148 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  27.51 
 
 
242 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  25.97 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  28.32 
 
 
245 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  28.49 
 
 
234 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  27.03 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2402  hypothetical protein  33.13 
 
 
219 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.745557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  36.84 
 
 
276 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  32.62 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  44.29 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  50 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  33.93 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  27.62 
 
 
198 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  29.41 
 
 
206 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  43.94 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  45.45 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  28.85 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  40.62 
 
 
155 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  41.27 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  49.15 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  49.09 
 
 
165 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  44.26 
 
 
142 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  41.18 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  25.43 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  46.3 
 
 
130 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  28.4 
 
 
186 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  42.62 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  24.87 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  28.26 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  38.71 
 
 
162 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  42.37 
 
 
211 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  41.94 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  39.06 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  35.71 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  37.7 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  43.4 
 
 
128 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  38.98 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  36.67 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5207  hypothetical protein  31.9 
 
 
284 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011067  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  41.82 
 
 
180 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  38.6 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  40.32 
 
 
156 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  36.76 
 
 
148 aa  41.2  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>