65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6397 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 		 128 aa  244  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  38.85 
 
 		 167 aa  80.1  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  55.74 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  44.57 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  49.28 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  53.45 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  36.36 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  36.67 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  32.26 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  50.88 
 
 		 227 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  51.56 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  40.96 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  39.47 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5463  hypothetical protein  34.78 
 
 		 292 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0317126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5374  hypothetical protein  34.78 
 
 		 292 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50658  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  31.13 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0043  protein of unknown function DUF1707  65.79 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  38.46 
 
 		 211 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5750  hypothetical protein  34.78 
 
 		 292 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  42.11 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  43.64 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  28.89 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6038  hypothetical protein  31.62 
 
 		 294 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  36.92 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0869  hypothetical protein  30.43 
 
 		 297 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  39.73 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  39.47 
 
 		 214 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  39.68 
 
 		 200 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  42.59 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  45.83 
 
 		 248 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  39.68 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  38.1 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  38.1 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  34.21 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  38.1 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  39.47 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  35.48 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0220  protein of unknown function DUF1707  41.82 
 
 		 217 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  46.3 
 
 		 218 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  42.86 
 
 		 229 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  47.27 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  39.19 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  43.86 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  42.59 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  39.66 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  43.86 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  42.86 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  41.07 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  37.18 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  38.18 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  42.86 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  36.62 
 
 		 156 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  44.23 
 
 		 234 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  43.4 
 
 		 175 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  38.89 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  40.74 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  40.74 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  40.74 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10047  hypothetical protein  37.88 
 
 		 289 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  41.51 
 
 		 175 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  42.59 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  33.8 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3422  protein of unknown function DUF1707  36.84 
 
 		 197 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>