100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0043 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0043  protein of unknown function DUF1707  100 
 
 
152 aa  296  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  43.87 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  40.54 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  47.55 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  41.78 
 
 
192 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  36.72 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  57.38 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  33.09 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  30.82 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  49.28 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  49.28 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  49.28 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0159  hypothetical protein  35.97 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  58.33 
 
 
229 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  55.88 
 
 
209 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  61.02 
 
 
227 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1879  hypothetical protein  47.89 
 
 
193 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.133446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  28.87 
 
 
165 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  35.29 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  43.9 
 
 
215 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  32.53 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  44.44 
 
 
200 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4852  hypothetical protein  47.14 
 
 
198 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  55.17 
 
 
218 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  35.56 
 
 
191 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  49.3 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  56.14 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  35.56 
 
 
190 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  32.59 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  45.71 
 
 
230 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  36.8 
 
 
206 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  55.93 
 
 
200 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  43.66 
 
 
200 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0582  hypothetical protein  34.78 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0604  hypothetical protein  34.78 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0591  hypothetical protein  34.78 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  36 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
217 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  48.15 
 
 
248 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  57.14 
 
 
175 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  51.47 
 
 
208 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  44.87 
 
 
206 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  47.83 
 
 
214 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
219 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  50.85 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  46.97 
 
 
204 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  43.82 
 
 
205 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  49.28 
 
 
206 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  49.23 
 
 
191 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  43.1 
 
 
192 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  46.43 
 
 
166 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  44.93 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  47.37 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  43.1 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  36.9 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4063  protein of unknown function DUF1707  37.8 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1934  protein of unknown function DUF1707  40.66 
 
 
217 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.495223  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  41.54 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1465  protein of unknown function DUF1707  42.5 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  42.62 
 
 
231 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  49.12 
 
 
206 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12878  hypothetical protein  32.58 
 
 
194 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  38.46 
 
 
196 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  39.34 
 
 
189 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  48.33 
 
 
234 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  36.47 
 
 
186 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  44.83 
 
 
194 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8941  hypothetical protein  47.14 
 
 
198 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
242 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  37.14 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  34.72 
 
 
242 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  49.12 
 
 
245 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  40.68 
 
 
200 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  53.33 
 
 
198 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  47.17 
 
 
276 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5374  hypothetical protein  35.37 
 
 
292 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5463  hypothetical protein  35.37 
 
 
292 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0317126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5750  hypothetical protein  35.37 
 
 
292 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  42.37 
 
 
190 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  49.18 
 
 
175 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  34.15 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  48.72 
 
 
217 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  50.88 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2094  hypothetical protein  37.1 
 
 
209 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147038  normal  0.565011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  33.96 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  47.17 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2048  hypothetical protein  37.1 
 
 
209 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.72536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  37.29 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2031  hypothetical protein  37.1 
 
 
209 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39520  protein of unknown function (DUF1707)  41.51 
 
 
219 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4075  hypothetical protein  36.84 
 
 
200 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295149  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2267  hypothetical protein  36.84 
 
 
211 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0869  hypothetical protein  37.25 
 
 
297 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.625441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2419  protein of unknown function DUF1707  36.71 
 
 
190 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000530954  hitchhiker  0.00553766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  29.33 
 
 
186 aa  40.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  41.18 
 
 
230 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>