39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5374 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5374  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  587  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5463  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  587  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0317126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5750  hypothetical protein  99.66 
 
 
292 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6038  hypothetical protein  72.2 
 
 
294 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0869  hypothetical protein  68.88 
 
 
297 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.625441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10047  hypothetical protein  56.18 
 
 
289 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  48.21 
 
 
214 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  50.98 
 
 
200 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  46.55 
 
 
192 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  44.29 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  42.42 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  46.3 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  31.86 
 
 
191 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  39.74 
 
 
161 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  42.03 
 
 
206 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  42.62 
 
 
209 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1882  protein of unknown function DUF1707  42.86 
 
 
187 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  40.51 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  37.5 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  36.49 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  45.1 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  38.55 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  47.06 
 
 
218 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  45.1 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  33.78 
 
 
146 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  39.22 
 
 
191 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  48.15 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  37.29 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6397  protein of unknown function DUF1707  34.78 
 
 
128 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1783  protein of unknown function DUF1707  40.32 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00805888  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  41.18 
 
 
200 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1209  hypothetical protein  38.1 
 
 
162 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0128328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  37.31 
 
 
206 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  40.74 
 
 
196 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  41.18 
 
 
197 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2992  protein of unknown function DUF1707  39.62 
 
 
195 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  39.39 
 
 
186 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  41.18 
 
 
197 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  38.46 
 
 
141 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>