50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2827 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2827  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0108  protein of unknown function DUF1707  57.41 
 
 
234 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  53.12 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  38.95 
 
 
214 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1084  protein of unknown function DUF1707  61.11 
 
 
227 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  36 
 
 
151 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  49.32 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  38.1 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  42.67 
 
 
161 aa  51.6  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  30.66 
 
 
154 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  54.72 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4653  hypothetical protein  46.77 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0286673  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  52.08 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  44.87 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  46.15 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3073  hypothetical protein  47.22 
 
 
229 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0460  hypothetical protein  59.26 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1210  hypothetical protein  28.83 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  49.06 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  48.44 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  31.11 
 
 
146 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  46.77 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  32.74 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7193  hypothetical protein  45.45 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0261332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  50.91 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2118  hypothetical protein  30.83 
 
 
147 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.824009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  43.94 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4690  hypothetical protein  44.64 
 
 
197 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  40.32 
 
 
186 aa  44.7  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4310  hypothetical protein  44.64 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  41.94 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4396  hypothetical protein  44.64 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  49.15 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4292  hypothetical protein  45.76 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0748  hypothetical protein  29.46 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166523  normal  0.738443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  48.89 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5750  hypothetical protein  39.39 
 
 
292 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5463  hypothetical protein  39.39 
 
 
292 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0317126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5374  hypothetical protein  39.39 
 
 
292 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0130  protein of unknown function DUF1707  46.3 
 
 
142 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3317  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 
205 aa  42  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  37.21 
 
 
211 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  45.83 
 
 
190 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  42.62 
 
 
157 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  39.29 
 
 
167 aa  41.2  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  34.04 
 
 
192 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10984  hypothetical protein  41.94 
 
 
230 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0957477  normal  0.68368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  34.04 
 
 
204 aa  40.8  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>