50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6748 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6748  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  328  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.311119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1747  protein of unknown function DUF1707  59.68 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1109  hypothetical protein  51.79 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4611  hypothetical protein  56.45 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2279  hypothetical protein  53.45 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0742127  normal  0.0286365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1467  hypothetical protein  50.82 
 
 
144 aa  58.2  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0587  hypothetical protein  45.45 
 
 
146 aa  57.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.780956  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4298  protein of unknown function DUF1707  54.1 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5147  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
154 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.442548 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5555  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
205 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805339  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0468  protein of unknown function DUF1707  49.06 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  35.58 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5241  protein of unknown function DUF1707  45.45 
 
 
213 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123261  hitchhiker  0.000688116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0958  protein of unknown function DUF1707  50 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0710  protein of unknown function DUF1707  49.06 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.113725 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2623  hypothetical protein  52.83 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.650859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2248  hypothetical protein  47.46 
 
 
248 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.470172  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1614  hypothetical protein  54.55 
 
 
190 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8488  hypothetical protein  44.44 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723517  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5024  hypothetical protein  45.28 
 
 
183 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0309891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1571  protein of unknown function DUF1707  28.05 
 
 
180 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00492338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5716  protein of unknown function DUF1707  51.92 
 
 
208 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5140  hypothetical protein  46.3 
 
 
191 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  45.45 
 
 
166 aa  47.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  44.23 
 
 
190 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6701  hypothetical protein  49.06 
 
 
276 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581822  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05840  protein of unknown function (DUF1707)  42.47 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98006  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1062  hypothetical protein  47.17 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2159  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6158  protein of unknown function DUF1707  47.83 
 
 
242 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.413297  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  39.66 
 
 
194 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1865  protein of unknown function DUF1707  41.54 
 
 
209 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4063  protein of unknown function DUF1707  56.1 
 
 
154 aa  44.3  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.0714175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4245  protein of unknown function DUF1707  43.4 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00888226  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1637  protein of unknown function DUF1707  38.98 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3071  hypothetical protein  44.23 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3291  protein of unknown function DUF1707  45.28 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247051  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4780  protein of unknown function DUF1707  48.08 
 
 
245 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.406753  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7061  protein of unknown function DUF1707  34.15 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0556  protein of unknown function DUF1707  42.67 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  35.85 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0062  protein of unknown function DUF1707  35.05 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8839  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 
191 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3836  protein of unknown function DUF1707  37.88 
 
 
156 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0270339  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2119  hypothetical protein  43.4 
 
 
161 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.333517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  27.14 
 
 
219 aa  41.2  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8053  FHA repeat-domain-containing protein-like protein  40.38 
 
 
181 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0730272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0038  hypothetical protein  40.74 
 
 
186 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6590  protein of unknown function DUF1707  40 
 
 
158 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6451  hypothetical protein  37.5 
 
 
192 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>