31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1372 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1372  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  232  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0149  hypothetical protein  39.29 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.162646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2891  hypothetical protein  35 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2511  hypothetical protein  35 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2185  hypothetical protein  30.36 
 
 
186 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000358474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2606  hypothetical protein  32.08 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.209325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0698  hypothetical protein  29.36 
 
 
210 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.677149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2895  hypothetical protein  34.95 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  31.19 
 
 
172 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2286  hypothetical protein  35.63 
 
 
249 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4385  hypothetical protein  28.85 
 
 
123 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01895  hypothetical protein  33.01 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02860  hypothetical protein  31.67 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70400  hypothetical protein  28.57 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6109  hypothetical protein  27.78 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12390  hypothetical protein  35.9 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00297914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4034  hypothetical protein  35.82 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.714126  normal  0.124652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5546  hypothetical protein  28.35 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4452  hypothetical protein  32 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4455  hypothetical protein  28.89 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2587  hypothetical protein  29.41 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000426932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0078  hypothetical protein  32.26 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0007  hypothetical protein  31.11 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146803  normal  0.457829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0699  hypothetical protein  32.04 
 
 
442 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0271  hypothetical protein  27.78 
 
 
118 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  hitchhiker  0.000000928921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3751  hypothetical protein  27.78 
 
 
118 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.855057  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0270  hypothetical protein  27.78 
 
 
118 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.280793  hitchhiker  0.0000338917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2439  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.221596  normal  0.0625542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3082  hypothetical protein  31.43 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000976095  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2198  hypothetical protein  28.93 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4122  hypothetical protein  26.32 
 
 
116 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>