20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2897 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  42.27 
 
 		 447 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  40.64 
 
 		 393 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  32.96 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  28.32 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  33.54 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  30.54 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  32.12 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  28.5 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  29.65 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  28.22 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  29.17 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  26.5 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  32.3 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  27.44 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  30 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3017  RDD domain containing protein  32.71 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  28.16 
 
 		 157 aa  42  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  35.23 
 
 		 375 aa  41.2  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>