37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0093 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  100 
 
 		 211 aa  413  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  44.97 
 
 		 152 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  36.36 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  36.67 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  29.57 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  34.23 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3132  hypothetical protein  37.93 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  33.56 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  27.51 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  32.08 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  28.42 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.86 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  30.1 
 
 		 447 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  27.5 
 
 		 276 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  28.86 
 
 		 424 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  31.41 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  27.81 
 
 		 393 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49805  predicted protein  35 
 
 		 389 aa  48.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  31.79 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  30.28 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  32.1 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  27.07 
 
 		 668 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  29.56 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  29.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  28.85 
 
 		 186 aa  45.1  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  33.1 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  34.48 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  32.03 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  29.25 
 
 		 137 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  39.73 
 
 		 163 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2964  hypothetical protein  26.92 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 		 313 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  31.9 
 
 		 323 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  32.58 
 
 		 159 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  36 
 
 		 156 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>