70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5436 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  100 
 
 
214 aa  421  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
264 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  37.14 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  33.55 
 
 
198 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  33.13 
 
 
272 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  32.05 
 
 
194 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  38.67 
 
 
393 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  32.03 
 
 
257 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  39.29 
 
 
165 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  34.69 
 
 
327 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  36.99 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  27.74 
 
 
157 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  26.9 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  28.86 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  29.45 
 
 
276 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  29.87 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1449  RDD domain-containing protein  35.42 
 
 
158 aa  52  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.413718  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  41.67 
 
 
211 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  32.21 
 
 
162 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  30 
 
 
138 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  35.62 
 
 
156 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  30.67 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  29.76 
 
 
166 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  28.99 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  30.64 
 
 
327 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  31.63 
 
 
162 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  32.67 
 
 
276 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  37.33 
 
 
165 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  32.71 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  27.87 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  34.36 
 
 
272 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  29.34 
 
 
247 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  28 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 
157 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  37.5 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  26.97 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  30.85 
 
 
162 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  29.03 
 
 
373 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  34.62 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  27.62 
 
 
310 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  30.85 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  30.85 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  30.85 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  30.38 
 
 
173 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  31.58 
 
 
149 aa  45.1  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  27.21 
 
 
135 aa  45.1  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  29.61 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  34.67 
 
 
141 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  31.68 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  39.47 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  32.19 
 
 
634 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  38.36 
 
 
375 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  28.02 
 
 
174 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  36 
 
 
415 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  36 
 
 
415 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  36 
 
 
412 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  36.59 
 
 
375 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  38.37 
 
 
322 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  27.11 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  36 
 
 
412 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  36 
 
 
444 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  29.66 
 
 
196 aa  42.4  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  36 
 
 
448 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  36 
 
 
449 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  37.33 
 
 
398 aa  42  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  22.92 
 
 
205 aa  42  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  28.3 
 
 
179 aa  41.6  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  32.43 
 
 
150 aa  41.6  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  36.99 
 
 
403 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>