62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0234 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  100 
 
 		 141 aa  289  1e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  42.14 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  43.88 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  45.45 
 
 		 151 aa  116  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  41.26 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  42.55 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  34.27 
 
 		 150 aa  90.1  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  33.57 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  33.57 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  33.1 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  39.71 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  28.77 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  41.77 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  25.87 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  40.51 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  34.62 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  30.25 
 
 		 157 aa  48.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  34.44 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  32.68 
 
 		 261 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  31.4 
 
 		 216 aa  47  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  36.17 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  30.38 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  33.82 
 
 		 634 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  29.41 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  37.68 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  32.94 
 
 		 272 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  34.78 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  34.78 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  29.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  32.18 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  40.85 
 
 		 198 aa  44.7  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  30 
 
 		 191 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  36 
 
 		 214 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  24.68 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  28.3 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  36.23 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  34.62 
 
 		 398 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  32.05 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  36.49 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0792  hypothetical protein  30.1 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  32.14 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  24.84 
 
 		 194 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 278 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  37.04 
 
 		 310 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  35.23 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  34.78 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  34.29 
 
 		 229 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  34.78 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  32.58 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  34.78 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  32.81 
 
 		 323 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  32.81 
 
 		 323 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  32.81 
 
 		 323 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  31.03 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  34.78 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 		 536 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  28.32 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02664  RDD family, putative  30.39 
 
 		 140 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>