88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4809 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4809  RDD  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  42.75 
 
 		 590 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  33.05 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  31.08 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  31.2 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  34.84 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  31.53 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  36.84 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  35.59 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  33.48 
 
 		 264 aa  89  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  30.9 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  32.2 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  32.07 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  28.16 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  31.95 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  36.48 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  29.02 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  29.65 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  34.73 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  34.94 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  32.02 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  50.59 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  29.79 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  33.55 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  35.62 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  28.7 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  27.04 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  27.35 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  31.25 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  29.38 
 
 		 272 aa  72  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  26.67 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  26.7 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  26.7 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  26.7 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  30.94 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  25.56 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  30.81 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  30.45 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  28.11 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  25.11 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  33.55 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  25.21 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  27.76 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  26.26 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  31.88 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  32.86 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  30.18 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  28.88 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  27.63 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  35.78 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  43.06 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  43.59 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  29.25 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  30.27 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  24.51 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  29.86 
 
 		 133 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  33.64 
 
 		 217 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  38.89 
 
 		 207 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  33.64 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  32.58 
 
 		 202 aa  49.3  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  32.71 
 
 		 166 aa  49.3  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.08 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  29.3 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  26.47 
 
 		 635 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  32.68 
 
 		 141 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  29.45 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 187 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  26.38 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  28.87 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  25.97 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  39.44 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  36.08 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  26.58 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  39.53 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  37.97 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  27.78 
 
 		 159 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  34.62 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1681  RDD domain containing protein  34.26 
 
 		 156 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  30.93 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  25.27 
 
 		 140 aa  43.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  36.76 
 
 		 198 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  35.53 
 
 		 137 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  29.41 
 
 		 327 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  24.48 
 
 		 155 aa  42  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  33.33 
 
 		 175 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 357 aa  42  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>