26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1405 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.61 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  41.77 
 
 		 241 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.85 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  43.75 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  28.29 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  41.77 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  40.74 
 
 		 80 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2053  RDD domain-containing protein  31.06 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  34.09 
 
 		 590 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  33.54 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  40.51 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  39.33 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  32.08 
 
 		 241 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  36.46 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  36.46 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  36.46 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  39.33 
 
 		 293 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  35 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  34.65 
 
 		 254 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  28.75 
 
 		 264 aa  42  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  35.44 
 
 		 241 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  32.98 
 
 		 274 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  35.23 
 
 		 265 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  37.8 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>