61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3574 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  100 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  43.24 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  40.26 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  34.43 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  42.24 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  34.65 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  39.19 
 
 		 231 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  38.93 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  39.19 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  34.66 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  30.74 
 
 		 590 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  30.53 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  37.42 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  31.95 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  33.66 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  34.83 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  35.25 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  32.69 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  33.54 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  33.7 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  32 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  28.49 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  34.85 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  31.06 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  32.34 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  40.96 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  30.73 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  28.08 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  31.08 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  28 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  26.7 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  31.76 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  30.64 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  26.73 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  32.39 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  47.89 
 
 		 80 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  27.49 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  29.22 
 
 		 310 aa  52  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  27.01 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  29.61 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  28.57 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  24.15 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  32.06 
 
 		 280 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  26.32 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  31.77 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  29.55 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  36.59 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  26.15 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  30.38 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  27.33 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  25.68 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  38.75 
 
 		 207 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  29.19 
 
 		 162 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  37.31 
 
 		 185 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  32.89 
 
 		 166 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  27.6 
 
 		 323 aa  42  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>