69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0409 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0409  RDD  100 
 
 		 231 aa  466  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  47.75 
 
 		 241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  49.04 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  48.44 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  52.41 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  47.75 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  44.3 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  47.94 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  42.22 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  33.78 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  39.74 
 
 		 274 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  35.43 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  42.86 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  38.99 
 
 		 265 aa  98.6  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  39.19 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  30.9 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  40.97 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  39.22 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  33.74 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  30.41 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  33.81 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  34.03 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  35.76 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  30.46 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  29.27 
 
 		 590 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  34.09 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  48.78 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  32.62 
 
 		 304 aa  61.6  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  34.23 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  33.1 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  33.92 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  34.29 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  33.06 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  31.91 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  30 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  31.91 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  31.91 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  31.93 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  29.58 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  27.78 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  31.51 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  33.54 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 288 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  30.07 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  28.93 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  35.96 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  39.77 
 
 		 175 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  52.4  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  30.72 
 
 		 310 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  31.72 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  27.07 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  32.92 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  27.01 
 
 		 170 aa  49.3  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  31.33 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  32.92 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  26.43 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  34.02 
 
 		 635 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  38.16 
 
 		 80 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  27.75 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  29.63 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  36.14 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  37.35 
 
 		 166 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  31.58 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  27.92 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  22.84 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  32.62 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  39.74 
 
 		 177 aa  41.6  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>