31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14930 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  690    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  44.57 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  33.8 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  47.68 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  39.62 
 
 		 168 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  34.87 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  34.44 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  35.14 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  33.12 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  44.21 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  33.59 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  37.33 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  38.3 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  27.66 
 
 		 154 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  29.48 
 
 		 202 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  39.51 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  31.17 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  42.25 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  42.25 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  42.25 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  32.95 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  31.82 
 
 		 198 aa  48.1  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  38.27 
 
 		 295 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  25.95 
 
 		 159 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  30.38 
 
 		 167 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  22.78 
 
 		 163 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3357  RDD family membrane protein  33.9 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0260303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  32.43 
 
 		 185 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  32.45 
 
 		 214 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  27.54 
 
 		 170 aa  43.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  29.45 
 
 		 185 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>