72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3583 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  37.93 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  35.67 
 
 		 185 aa  96.3  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  38.41 
 
 		 185 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  35.37 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  38.62 
 
 		 187 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  37.76 
 
 		 145 aa  87.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  38.13 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  31.69 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  36.67 
 
 		 186 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  33.53 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  38.52 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  29.68 
 
 		 424 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  35.71 
 
 		 167 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  31.97 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  32.89 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  32.41 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  27.97 
 
 		 159 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  28.14 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  32.86 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 		 536 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  27.1 
 
 		 166 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  43.37 
 
 		 211 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  28.38 
 
 		 634 aa  52.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 157 aa  52.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  40.3 
 
 		 1163 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  25.81 
 
 		 166 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  29.93 
 
 		 154 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  35.37 
 
 		 155 aa  52  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  51.35 
 
 		 434 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  25.49 
 
 		 442 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  37.74 
 
 		 1124 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  34.83 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  39.74 
 
 		 421 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  31.25 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  32.69 
 
 		 202 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  27.63 
 
 		 173 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  34 
 
 		 365 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  27.63 
 
 		 174 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  38.75 
 
 		 1144 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  34.83 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  35.82 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  26.92 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  44.68 
 
 		 1139 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  26.32 
 
 		 174 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0190  Zinc finger-domain-containing protein  51.43 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0243278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  30.14 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2662  hypothetical protein  51.43 
 
 		 490 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  29.47 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  25.47 
 
 		 453 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  30.26 
 
 		 138 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  34.72 
 
 		 154 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  32.29 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  42.03 
 
 		 77 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  27.4 
 
 		 146 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  35.21 
 
 		 408 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  29.09 
 
 		 446 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  28.99 
 
 		 137 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  40.91 
 
 		 361 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1116  hypothetical protein  26.17 
 
 		 471 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  29.69 
 
 		 162 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  34.85 
 
 		 137 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  26.81 
 
 		 174 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  27.55 
 
 		 376 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  28.72 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  26.03 
 
 		 240 aa  42.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>