75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2289 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  35 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  33.17 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  31.86 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  37.66 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  43.79 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  39.35 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  37.66 
 
 		 145 aa  89.4  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  31.64 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  41.12 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  32.97 
 
 		 424 aa  74.7  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  30.94 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  31.5 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  26.72 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  40.91 
 
 		 133 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  41.76 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  31.09 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  26.97 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  29.19 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  27.72 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  40.58 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  32.71 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  38.81 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  31.71 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  45.71 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  27.04 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  25.6 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  25.27 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  29.7 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  26.83 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  37.31 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  31.52 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  27.52 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  27.78 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  27.78 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  27.78 
 
 		 162 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 634 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  33.33 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  38.24 
 
 		 278 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  27.39 
 
 		 168 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  25.79 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  29.38 
 
 		 174 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  32.05 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  28.1 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  56.1 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  0.000011217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26350  hypothetical protein  34.25 
 
 		 794 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00144555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  32.84 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  24.31 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  29.94 
 
 		 254 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  28.83 
 
 		 511 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  26.17 
 
 		 162 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  35.44 
 
 		 590 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  27.03 
 
 		 313 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  24.85 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  28.14 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0793  hypothetical protein  30.59 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  30.99 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  28.7 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  28.42 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  26.14 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1044  RDD domain containing protein  27.39 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  35.62 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  27.47 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  32.89 
 
 		 406 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  28.07 
 
 		 173 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.45 
 
 		 1149 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0574  hypothetical protein  37.5 
 
 		 289 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  27.22 
 
 		 162 aa  42  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0494  hypothetical protein  63.64 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  32.5 
 
 		 145 aa  41.2  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>