48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1918 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  100 
 
 		 154 aa  310  5.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2108  RDD protein  41.18 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2282  RDD domain containing protein  38.51 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1846  RDD family protein  39.39 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1510  conserved hypothetical protein (RDD domain protein)  36.07 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1779  RDD protein  38.69 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0257  hypothetical protein  34.15 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0283  hypothetical protein  34.38 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0230  hypothetical protein  33.06 
 
 		 136 aa  87  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0342  RDD protein  37.04 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  30.41 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  31.61 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  32.24 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  24.83 
 
 		 257 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  31.82 
 
 		 361 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  28.15 
 
 		 278 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  31.58 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  28.08 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  29.58 
 
 		 357 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  24.07 
 
 		 365 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  38.96 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  28.49 
 
 		 424 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  28.08 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  25.55 
 
 		 270 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  28.77 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  27.27 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  34.72 
 
 		 295 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  37.08 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  34.62 
 
 		 261 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  27.18 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  31.08 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  30.85 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  24.62 
 
 		 167 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  26.37 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  25.16 
 
 		 168 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  23.29 
 
 		 154 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  30.85 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  37.68 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  34.83 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49805  predicted protein  35.29 
 
 		 389 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  29.63 
 
 		 185 aa  41.2  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2450  RDD domain-containing protein  31.91 
 
 		 221 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0128702  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  24.81 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  30 
 
 		 319 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2378  RDD domain-containing protein  32.17 
 
 		 221 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000398185  normal  0.783398 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  23.53 
 
 		 216 aa  40.4  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>