32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11096 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  100 
 
 		 240 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  51.9 
 
 		 168 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  45.06 
 
 		 167 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  39.02 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  36.63 
 
 		 373 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  35.8 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  32.1 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  46.48 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  42.25 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  32.29 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  42.19 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  35.38 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  35.38 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  35.38 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  41.98 
 
 		 1821 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  41.03 
 
 		 839 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3614  Forkhead-associated protein  46.15 
 
 		 835 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158405  hitchhiker  0.00251691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  37.7 
 
 		 327 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  23.85 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  35.62 
 
 		 214 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.67 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  29.94 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  34.38 
 
 		 888 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0836  hypothetical protein  28.17 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  32.43 
 
 		 832 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  26.03 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4233  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  42.86 
 
 		 786 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  37.23 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  34.62 
 
 		 846 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 175 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  41.07 
 
 		 1144 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0854  hypothetical protein  44 
 
 		 419 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0320102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>