14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2662 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2662  hypothetical protein  100 
 
 
490 aa  983    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  28.46 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  26.25 
 
 
335 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  45 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  30.09 
 
 
327 aa  53.5  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2389  MJ0042 family finger-like protein  26.67 
 
 
312 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  37.23 
 
 
270 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0513  protein of unknown function DUF898 transmembrane  30.38 
 
 
408 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308332  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0595  hypothetical protein  32.29 
 
 
428 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000214517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  44.74 
 
 
434 aa  47  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  51.43 
 
 
295 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1951  MJ0042 family finger-like protein  22.57 
 
 
321 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.683994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  28 
 
 
241 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0087  hypothetical protein  29.37 
 
 
195 aa  43.9  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>