34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14920 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  100 
 
 		 365 aa  708    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  43.21 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1981  RDD domain containing protein  36.36 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2856  RDD domain containing protein  44.08 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal  0.0112098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  31.61 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11096  proline rich antigen pra  34.64 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000111631  normal  0.296478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  48.65 
 
 		 272 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  31.03 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  33.91 
 
 		 168 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2045  RDD domain-containing protein  31.1 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000733999  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0141  RDD domain-containing protein  37.27 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  31.98 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10177  MCE associated membrane protein  42.17 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0115  RDD domain-containing protein  43.33 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0134  RDD domain-containing protein  43.33 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0125  RDD domain-containing protein  43.33 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  34 
 
 		 295 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  24.07 
 
 		 154 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1044  RDD domain containing protein  26.82 
 
 		 165 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  31.82 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  28.66 
 
 		 185 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  29.38 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  29.79 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  37.97 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 		 254 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  29.13 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  27.71 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  29.13 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  29.13 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 444 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  28.93 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  31.82 
 
 		 668 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>