35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1509 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  760    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  45.71 
 
 		 414 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  44.59 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  45.73 
 
 		 375 aa  288  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  41.75 
 
 		 449 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  40.45 
 
 		 444 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  42.45 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  42.45 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  43.87 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  44.79 
 
 		 398 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  41.35 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  42.55 
 
 		 412 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  42.16 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  36.27 
 
 		 453 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  36.69 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  37.04 
 
 		 175 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  41.46 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  32.95 
 
 		 247 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  36.67 
 
 		 310 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  35.88 
 
 		 211 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  40.48 
 
 		 166 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  34.26 
 
 		 140 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 		 166 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  34.88 
 
 		 165 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  38.82 
 
 		 166 aa  47  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  34.88 
 
 		 165 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 		 536 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  31.82 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  37.21 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  32.18 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  34.15 
 
 		 165 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  39.44 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  37.14 
 
 		 141 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  28.33 
 
 		 185 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>