33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2514 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 453 aa  930    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  37.05 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  35.87 
 
 		 403 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  36.27 
 
 		 375 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  31.09 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  34.97 
 
 		 449 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  34.12 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  30.79 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  69.37 
 
 		 375 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  33.63 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  63.64 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  62.28 
 
 		 415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  62.28 
 
 		 415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  67.31 
 
 		 444 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  68 
 
 		 376 aa  160  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  43.59 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  39.51 
 
 		 204 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  38.46 
 
 		 166 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  32.05 
 
 		 145 aa  48.5  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  40.51 
 
 		 166 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  33.33 
 
 		 175 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  54.55 
 
 		 304 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  34.91 
 
 		 310 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  34.09 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  37.8 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 		 536 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  39.24 
 
 		 166 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  28.32 
 
 		 265 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  25.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  34.15 
 
 		 165 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  44.9 
 
 		 274 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 165 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  34.15 
 
 		 165 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>