71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4266 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  44.35 
 
 
254 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  43.65 
 
 
258 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  38.91 
 
 
265 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  32.79 
 
 
279 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  39.74 
 
 
231 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  31.06 
 
 
590 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  31.53 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  33.77 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  26.36 
 
 
237 aa  93.6  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  35.29 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  36.73 
 
 
241 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  37.5 
 
 
241 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  39.61 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  34.01 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  29.83 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  34.72 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  32.87 
 
 
151 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  24.18 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  33.1 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  32.03 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  28.57 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  31.29 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  33.58 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  33.11 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  30.37 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  33.8 
 
 
264 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  26.29 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  30.67 
 
 
340 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  36.45 
 
 
175 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  28.12 
 
 
306 aa  62.4  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  28.71 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  33.83 
 
 
343 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  25 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  26.69 
 
 
247 aa  59.3  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  28.48 
 
 
293 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  29.71 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  24.65 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  30.83 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  31.46 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  28.16 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  25.68 
 
 
310 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  25 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  45.95 
 
 
80 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  29.94 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  26.02 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  26.06 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  26.06 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  26.06 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  45.07 
 
 
207 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  29.77 
 
 
302 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  31.31 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  29.75 
 
 
288 aa  49.3  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  27.67 
 
 
169 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  28.08 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  34.94 
 
 
166 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  26.18 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  28 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  29.29 
 
 
406 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  27.21 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  29.38 
 
 
365 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  34.83 
 
 
635 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  44.9 
 
 
453 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  30.14 
 
 
174 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  26.67 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  29.21 
 
 
159 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  30.86 
 
 
166 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  25.85 
 
 
152 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2964  hypothetical protein  26.49 
 
 
199 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  31.34 
 
 
205 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.052067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>