66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3579 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  100 
 
 		 265 aa  533  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  45.02 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  45.27 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  39.44 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  44.83 
 
 		 241 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  30.83 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  38.98 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  41.5 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  43.45 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  34.43 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  39.2 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  38.99 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  41.45 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  42.76 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  31.73 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  31.54 
 
 		 590 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  26.95 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  34.18 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  38.57 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  23.32 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  30.94 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  30.85 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  28.93 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  35.66 
 
 		 151 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  28.45 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  32.19 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  30.61 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  36.84 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  26.45 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  27.5 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  27.02 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  34.01 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  26.4 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  23.39 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  28.65 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  28.65 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  28.65 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  30.67 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  27.16 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  29.66 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0461  RDD  26.41 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.253425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  28.79 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  24.61 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  31.85 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  32.93 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  24.67 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  28.77 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  28.4 
 
 		 635 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  28.66 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  32.63 
 
 		 406 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  34.78 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  28 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  24.51 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  27.69 
 
 		 453 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09620  RDD domain containing protein  27.27 
 
 		 302 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  40.28 
 
 		 80 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  34.62 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  26.81 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  37.23 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1681  RDD domain containing protein  31.9 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  30.13 
 
 		 159 aa  42.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  32.21 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  26.23 
 
 		 415 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  26.23 
 
 		 415 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  29.37 
 
 		 272 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>