131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1175 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  86.75 
 
 		 166 aa  298  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  87.95 
 
 		 166 aa  280  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  39.86 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  32.68 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  38 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  47.5 
 
 		 270 aa  80.9  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  43.62 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  43.62 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  43.62 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  42.39 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  43.62 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  32.65 
 
 		 634 aa  78.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  41.57 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  41.57 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  31.72 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  30.38 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  41.25 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  36.84 
 
 		 406 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  31.54 
 
 		 310 aa  64.7  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  31.72 
 
 		 295 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  41.33 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  32 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  33.12 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  32.68 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  29.66 
 
 		 149 aa  62  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  27.78 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  32.06 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  34.12 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  30.43 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  30.14 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  31.17 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  34.64 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  36.25 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  29.75 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0161  RDD  27.33 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  28.86 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  30 
 
 		 424 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  34 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  35.44 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  32.03 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  27.15 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  36.67 
 
 		 414 aa  53.9  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  27.1 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  35.56 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  28.38 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  29.33 
 
 		 254 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  35 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  30.2 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  28.67 
 
 		 258 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  29.68 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  38.46 
 
 		 453 aa  51.6  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  33.78 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  27.97 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  29.7 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  38.55 
 
 		 403 aa  50.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  30.12 
 
 		 261 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  27.52 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  30.57 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  27.98 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  25.68 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  32.87 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  29.73 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  30.77 
 
 		 211 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  26.85 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  36.25 
 
 		 375 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  28.86 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  48.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  32.41 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  27.63 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  35.71 
 
 		 375 aa  47.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  30.56 
 
 		 174 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  35.78 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  35.9 
 
 		 265 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  38.3 
 
 		 258 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  35.23 
 
 		 424 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  26.17 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 444 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 448 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 449 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  39.74 
 
 		 398 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  27.54 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  28.31 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 412 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  28.07 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 415 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  27.22 
 
 		 264 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 412 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  27.7 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  37.5 
 
 		 415 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  28.97 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  28 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  26.17 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  27.59 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  30.13 
 
 		 231 aa  44.7  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>