19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0505 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  100 
 
 		 152 aa  308  2.9999999999999997e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  49.32 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  49.32 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  42.57 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  40.69 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  37.84 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  40.4 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  38.51 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  33.1 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  33.33 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  29.81 
 
 		 406 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  28.67 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  38.24 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  36.76 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  26.57 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  32.91 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  25.53 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  25.85 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>