89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2080 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  67.3 
 
 		 159 aa  220  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  66.04 
 
 		 159 aa  216  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  50.66 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  43.67 
 
 		 184 aa  140  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  40.51 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  39.87 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  39.24 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0942  RDD domain-containing protein  39.87 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.565346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  39.24 
 
 		 169 aa  123  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  38.61 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  39.24 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  38.61 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  38.61 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1260  RDD domain containing protein  38.61 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014727  hitchhiker  0.000226735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1017  RDD domain-containing protein  38.96 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.113212  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0798  hypothetical protein  38.46 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  37.66 
 
 		 174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0913  RDD domain-containing protein  35.95 
 
 		 174 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  41.18 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0876  hypothetical protein  37.5 
 
 		 169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0927  RDD domain-containing protein  35.03 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  36.94 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  32.32 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  32.32 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  32.32 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3559  RDD domain-containing protein  37.84 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0544262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  33.96 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  33.99 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  34.48 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  33.55 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01573  RDD domain containing protein  36.96 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  34.16 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  34.39 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  35.06 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0964  RDD domain-containing protein  38.14 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  28.93 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2111  RDD domain containing protein  35.09 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0561  RDD domain-containing protein  34.86 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0106265  hitchhiker  0.00000244138 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  30.46 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  34.19 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  30.5 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  30.97 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  30.06 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0180  RDD domain-containing protein  28.44 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000223601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1041  RDD family protein  33.93 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0802287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1269  RDD family protein  33.04 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1276  RDD family protein  33.04 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1415  RDD family protein  33.04 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.219547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0392  RDD family protein  33.04 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1109  RDD family protein  33.04 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.851219  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2307  RDD domain-containing protein  32.11 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0757  RDD family protein  33.04 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1979  RDD domain containing protein  28.93 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0168  hypothetical protein  27.52 
 
 		 224 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.225097  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  25.17 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  30.52 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  36.26 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5596  RDD family protein  28.44 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2269  RDD domain-containing protein  28.04 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1658  RDD domain-containing protein  28.04 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  24.85 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2292  RDD domain-containing protein  28.04 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0339  RDD domain-containing protein  28.44 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257721  hitchhiker  0.00000000478275 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2185  RDD domain-containing protein  45.83 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0182682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  26.24 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0805  RDD domain containing protein  29.31 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.951313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2897  RDD domain-containing protein  28.97 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1009  RDD domain-containing protein  43.75 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.305879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0907  RDD domain-containing protein  29.36 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3235  putative transmembrane protein  24.12 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0624829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1067  RDD domain-containing protein  28.07 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.172347  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1324  RDD domain containing protein  23.53 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1619  RDD  27.71 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2240  RDD domain containing protein  27.72 
 
 		 194 aa  44.3  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  30.25 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3318  RDD  22.09 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  30.84 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  22.97 
 
 		 310 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1741  RDD domain-containing protein  25.69 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  27.39 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3116  RDD domain-containing protein  21.08 
 
 		 189 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0215825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4871  RDD domain-containing protein  22.42 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.945558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0117  hypothetical protein  34.67 
 
 		 279 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110318  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0101  RDD domain-containing protein  34.67 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0943  RDD  31.62 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  27.84 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>