81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2713 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  72.39 
 
 
156 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  36.3 
 
 
257 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  37.78 
 
 
270 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  34.38 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  28.48 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  32.64 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  30 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  31.43 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  32.89 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  31.08 
 
 
310 aa  64.7  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  30.71 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  34.29 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  27.27 
 
 
295 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  30.82 
 
 
185 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  31.61 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  29.79 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  30.82 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
634 aa  58.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  29.66 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  31.08 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  31.11 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  26.9 
 
 
214 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3395  RDD domain-containing protein  27.1 
 
 
224 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  27.86 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 
415 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  27.78 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  28.21 
 
 
424 aa  51.6  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  29.56 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  26.95 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  32.93 
 
 
316 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  39.77 
 
 
262 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  39.77 
 
 
262 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  39.77 
 
 
262 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1044  RDD domain containing protein  25.86 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
536 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  26.21 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  29.73 
 
 
165 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3357  RDD family membrane protein  24.18 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0260303 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  27.08 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  28.79 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  28.72 
 
 
276 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  28.83 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  25.49 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  25.42 
 
 
204 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  26.67 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  29.79 
 
 
272 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  29.89 
 
 
196 aa  44.7  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  27.78 
 
 
261 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  27.27 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  26.97 
 
 
229 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1449  RDD domain-containing protein  31.33 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.413718  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  26.8 
 
 
340 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  29.19 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  31.68 
 
 
323 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  27.06 
 
 
202 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  29.89 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  32.12 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  28.23 
 
 
343 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  29.21 
 
 
274 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2053  RDD domain-containing protein  24.62 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  31.39 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  29.33 
 
 
241 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  30.77 
 
 
406 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  33.71 
 
 
280 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14930  hypothetical protein  25.95 
 
 
361 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.10633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  28.08 
 
 
174 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  28.75 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  31.76 
 
 
278 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  36.62 
 
 
293 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  32.58 
 
 
211 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  27.59 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  27.59 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2378  RDD domain-containing protein  21.89 
 
 
221 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000398185  normal  0.783398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  34.85 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  21.79 
 
 
195 aa  41.6  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  27.59 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  33.33 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 
175 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  28.86 
 
 
235 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2450  RDD domain-containing protein  21.89 
 
 
221 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0128702  normal  0.279252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>