91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1788 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  100 
 
 		 187 aa  379  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  50.99 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  47.55 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  47.26 
 
 		 145 aa  118  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  35.68 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  42.95 
 
 		 310 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  44 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  36.52 
 
 		 217 aa  104  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  34.71 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  41.84 
 
 		 140 aa  89.4  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  38.62 
 
 		 295 aa  88.6  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 		 415 aa  84.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  33.81 
 
 		 133 aa  84.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  32.69 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  36.97 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  42.17 
 
 		 536 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  43.62 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  39.35 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  34.03 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  37.23 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  36.31 
 
 		 424 aa  71.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  30 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  34.21 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  28.65 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  45.95 
 
 		 77 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  28.06 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  35.33 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  30.25 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  32.65 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  30.41 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  34.01 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  32.08 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  28.22 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  31.47 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  27.93 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  32.28 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  31.01 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  29.94 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  0.000011217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  30.34 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  38.64 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  27.45 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  31.39 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  33.12 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  28.32 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  33.1 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  29.66 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  28.97 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  26.97 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  30.56 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  26.43 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  31.96 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  26.57 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  29.25 
 
 		 634 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  28.57 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  30.87 
 
 		 285 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  25.4 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  34.09 
 
 		 590 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  32.98 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  27.1 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  28.93 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  26.57 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  31.37 
 
 		 166 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  23.33 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  30.71 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  30 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  27.03 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  28.93 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  35.11 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  26.47 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  29.68 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5164  RDD domain containing protein  26.03 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  28.39 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  39.77 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  24.12 
 
 		 323 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  34.15 
 
 		 415 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  34.12 
 
 		 448 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  34.12 
 
 		 449 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  34.15 
 
 		 412 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  34.15 
 
 		 412 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  34.15 
 
 		 415 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  34.12 
 
 		 444 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  28.97 
 
 		 214 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  27.06 
 
 		 279 aa  41.6  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  26.24 
 
 		 247 aa  41.6  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  26.9 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2847  RDD family membrane protein  24.79 
 
 		 329 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  31.65 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>