36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1844 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1844  RDD  100 
 
 		 173 aa  340  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  36.96 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  36.17 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  35.86 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  37.59 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  34.23 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  36.57 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  35.04 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  36.17 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  31.33 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  28.87 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  32.86 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  31.72 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  29.55 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  32.37 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  29.55 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  30.43 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  30.67 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  31.88 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  29.46 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  37.8 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  28.68 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  30.13 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  33.1 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  28.68 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  27.54 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  28.68 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  26.81 
 
 		 187 aa  44.3  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  26.03 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  24.16 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  27.33 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  32.56 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  30.43 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  35.9 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  25 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>