36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2885 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  43.64 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  45 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  37.57 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  44.6 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  42.14 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  41.06 
 
 		 181 aa  97.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  43.8 
 
 		 180 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  40.85 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  38.41 
 
 		 154 aa  94.4  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  43.26 
 
 		 152 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  34.57 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  36.84 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  36.84 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  37.91 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  36.84 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  34.81 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  36.23 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  36.84 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  30.56 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  30.56 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  30.3 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  32.41 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  37.35 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  33.85 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  33.08 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  36.5 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  30.43 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  26.87 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  32.61 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  31.08 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  27.5 
 
 		 295 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1176  RDD domain-containing protein  34.88 
 
 		 150 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  33.08 
 
 		 150 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1779  RDD protein  30 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  33.08 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>