32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0756 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  94.23 
 
 		 156 aa  298  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  59.86 
 
 		 152 aa  166  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  55.22 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  53.24 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  47.33 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  51.8 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  40.29 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  40.97 
 
 		 181 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  41.06 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  43.48 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  39.16 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  35.44 
 
 		 188 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  42.75 
 
 		 179 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  40.15 
 
 		 175 aa  97.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  38.35 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  37.78 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  40.6 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  37.23 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  36.84 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  37.96 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  37.96 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  36.09 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  34.06 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  35.88 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  29.77 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0674  RDD  24.05 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  28.7 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  27.27 
 
 		 668 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  27.15 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>