36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1128 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  294  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  59.86 
 
 		 156 aa  166  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  59.86 
 
 		 156 aa  166  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  58.45 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  48.68 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  53.28 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  50.74 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  51.47 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  42.21 
 
 		 188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  41.83 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  41.18 
 
 		 185 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  41.67 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  44.2 
 
 		 181 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  44.53 
 
 		 180 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  43.07 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  42.75 
 
 		 179 aa  103  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  43.26 
 
 		 175 aa  94  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  39.55 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  41.04 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  38.13 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  37.98 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  38.93 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  38.93 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  38.17 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  35.11 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  33.81 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0674  RDD  26.25 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  31.76 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 		 536 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  34.29 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0331  RDD family protein  24.36 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  29.1 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  31.47 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  28.15 
 
 		 668 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>