38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1910 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  353  7.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  79.55 
 
 		 179 aa  275  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  66.48 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  68.05 
 
 		 185 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  67.9 
 
 		 175 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  62.57 
 
 		 188 aa  227  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  63.28 
 
 		 181 aa  224  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  45.61 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  43.64 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  43.14 
 
 		 152 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  41.01 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  42.75 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  43.48 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  41.56 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  43.48 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  43.48 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  39.87 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  40.29 
 
 		 157 aa  84.3  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  36.76 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  31.1 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  34.53 
 
 		 164 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  35.56 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  30.25 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  30.25 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  36.49 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  35.07 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  33.56 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1176  RDD domain-containing protein  31.51 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  26.86 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  30.14 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  30.14 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  27.7 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  33.1 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  33.55 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  29.65 
 
 		 310 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  26.39 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06647  hypothetical protein  37.84 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>