77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1706 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1706  RDD  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  50.99 
 
 		 187 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  49.64 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  41.01 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  42.14 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  45.21 
 
 		 145 aa  108  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  36.36 
 
 		 310 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  44.14 
 
 		 140 aa  98.2  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  42.03 
 
 		 217 aa  95.5  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  32.54 
 
 		 202 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  36.76 
 
 		 133 aa  84.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  39.13 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  38.03 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  37.66 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  38.13 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  43.96 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  30.77 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  28.48 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  34.84 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 		 536 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  31.94 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  30.72 
 
 		 456 aa  68.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  27.81 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  28.77 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  44.59 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  27.93 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  28.66 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  41.67 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  32.62 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  30.22 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  34.27 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  34.64 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  31.47 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  26.09 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  25.9 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  33.9 
 
 		 327 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  29.94 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  28.89 
 
 		 634 aa  50.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  26.87 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  31.21 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  27.66 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  27.01 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  28.17 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  25.9 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  29.49 
 
 		 246 aa  47.8  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  34.72 
 
 		 278 aa  47.4  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  31.97 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  39.24 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  27.34 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  38 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  0.000011217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  27.27 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  26.38 
 
 		 261 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  30 
 
 		 204 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  25.17 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  25.17 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  25.17 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  27.59 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2847  RDD family membrane protein  30.43 
 
 		 329 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  25.71 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  28.87 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  26.39 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  24.67 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  27.66 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  35.37 
 
 		 444 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  35.8 
 
 		 449 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  35.8 
 
 		 448 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  34.57 
 
 		 415 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  35.9 
 
 		 166 aa  42  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  25.9 
 
 		 181 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 415 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 412 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 412 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  32.84 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  27.12 
 
 		 590 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  28 
 
 		 258 aa  40.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  35.8 
 
 		 376 aa  40.8  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>