59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7601 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  100 
 
 
327 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  45.75 
 
 
343 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  40 
 
 
340 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  40.34 
 
 
316 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  42.75 
 
 
272 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  44.18 
 
 
262 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  44.18 
 
 
262 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  44.18 
 
 
262 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  46.15 
 
 
288 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  39.77 
 
 
268 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  41.11 
 
 
272 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  43.8 
 
 
272 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  42.15 
 
 
264 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  40.65 
 
 
293 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  39.59 
 
 
323 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  39.85 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  38.64 
 
 
310 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  42.17 
 
 
280 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  38 
 
 
269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  43.24 
 
 
269 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  37.35 
 
 
266 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  41.98 
 
 
282 aa  133  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  33.21 
 
 
286 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  40.65 
 
 
285 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.08 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  30.12 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  36.49 
 
 
241 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  37.76 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  32.48 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  32.6 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  34.46 
 
 
241 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  37.58 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  32.89 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  38.57 
 
 
150 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  32.73 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  26.64 
 
 
590 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  30.14 
 
 
237 aa  67  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  31.52 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  27.89 
 
 
255 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  35.33 
 
 
265 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  28.44 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  31.48 
 
 
223 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  33.33 
 
 
170 aa  56.2  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  26.05 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  36.14 
 
 
241 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  31.91 
 
 
162 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  23.83 
 
 
247 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  32 
 
 
270 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  33.03 
 
 
668 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  37.96 
 
 
175 aa  46.2  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  30.53 
 
 
406 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  26.17 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  39.19 
 
 
80 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  28.21 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  25.73 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  24.67 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  33.06 
 
 
447 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  34.48 
 
 
151 aa  43.1  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  29.45 
 
 
159 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>