78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0726 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  100 
 
 		 156 aa  316  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  72.39 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  39.44 
 
 		 270 aa  90.5  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  31.29 
 
 		 257 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  35.25 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  32.86 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  31.37 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  32.5 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  28.76 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  32.17 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  28.19 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  33.76 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  30.25 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  32.41 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  35.8 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  28.87 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  32.58 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  29.81 
 
 		 424 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  28.87 
 
 		 211 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 536 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  30.94 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  28.39 
 
 		 191 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  32.59 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  29.58 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  31.39 
 
 		 634 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  33.8 
 
 		 316 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  34.57 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  32.19 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3395  RDD domain-containing protein  28.74 
 
 		 224 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  26.62 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  30.22 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  31.11 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  30.26 
 
 		 276 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  32.18 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1449  RDD domain-containing protein  35.87 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.413718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2378  RDD domain-containing protein  27.59 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000398185  normal  0.783398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2450  RDD domain-containing protein  27.59 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0128702  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3357  RDD family membrane protein  21.62 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0260303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  27.92 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  40.51 
 
 		 262 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  28.19 
 
 		 261 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  40.51 
 
 		 262 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  40.51 
 
 		 262 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  24.32 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  26.32 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  32.24 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  34.69 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  34.65 
 
 		 293 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  34.69 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  34.65 
 
 		 280 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  33.8 
 
 		 340 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  32.5 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  38.46 
 
 		 406 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  35.63 
 
 		 211 aa  43.9  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  28.67 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  31.76 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  35.23 
 
 		 343 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  33.73 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  25.34 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  32.58 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  36.05 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  31.68 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  31.68 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  31.68 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  29.56 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  27.59 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  25.81 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2053  RDD domain-containing protein  26.15 
 
 		 150 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  35.38 
 
 		 77 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  34.12 
 
 		 246 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  26.83 
 
 		 229 aa  41.2  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  36.36 
 
 		 272 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  26.44 
 
 		 258 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  32.35 
 
 		 393 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1336  hypothetical protein  30.38 
 
 		 327 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000287065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  31.03 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  32.56 
 
 		 258 aa  40.8  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>