57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1449 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1449  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.413718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  40.21 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  31.33 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  31.82 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  31.46 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  37.31 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  34.75 
 
 		 727 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  36.73 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  39.36 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  38.04 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  34.52 
 
 		 453 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  24.81 
 
 		 257 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 375 aa  48.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2976  RDD domain-containing protein  28.66 
 
 		 308 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0648796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3018  RDD domain-containing protein  28.66 
 
 		 308 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.792244  normal  0.129954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  39.36 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  34.94 
 
 		 449 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  34.94 
 
 		 444 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  34.94 
 
 		 448 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  39.73 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  33.73 
 
 		 412 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  33.73 
 
 		 415 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  32.08 
 
 		 424 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  33.73 
 
 		 415 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  37.78 
 
 		 414 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  33.73 
 
 		 412 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  41.03 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  33.73 
 
 		 398 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  34.94 
 
 		 376 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  27.61 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  35.71 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  28.99 
 
 		 274 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  33.7 
 
 		 403 aa  44.3  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  36.96 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  35.07 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  36.96 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  36.96 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  36.9 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  29.66 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  26.06 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  33.33 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  35.21 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  26.12 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  35.34 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  40 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  37.5 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  35.87 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  30.86 
 
 		 187 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  23.88 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  34.33 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  30.86 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  26.49 
 
 		 247 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  30.59 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  27.66 
 
 		 254 aa  40.8  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  31.07 
 
 		 231 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  34.94 
 
 		 265 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>