36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1683 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 424 aa  858    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  46.25 
 
 		 403 aa  342  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  49.1 
 
 		 375 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  43.07 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  42.48 
 
 		 415 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  42.48 
 
 		 415 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  41.59 
 
 		 444 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  43.25 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  43.69 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  41.41 
 
 		 449 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  39.58 
 
 		 448 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  39.72 
 
 		 398 aa  286  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  42.16 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  40.38 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  32.45 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  29.41 
 
 		 247 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  37.5 
 
 		 270 aa  50.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  36.49 
 
 		 141 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  33.96 
 
 		 310 aa  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  37.04 
 
 		 175 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 162 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  37.62 
 
 		 211 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  35.23 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  35.23 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  35.23 
 
 		 162 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  35.23 
 
 		 166 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  40 
 
 		 162 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  35.23 
 
 		 166 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  31.4 
 
 		 165 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14920  predicted membrane protein/domain protein  30.77 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0445754  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  31.43 
 
 		 185 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  35.71 
 
 		 157 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  29.67 
 
 		 257 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>