40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0926 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  100 
 
 		 157 aa  304  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  49.09 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  42.77 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  42.77 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  45.99 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  43.64 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  42.31 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  41.88 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  41.88 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  41.88 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  40.79 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  46.15 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  42.34 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  38.95 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  42.04 
 
 		 154 aa  94.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  47.02 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  43.4 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  41.88 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  42.42 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  44.72 
 
 		 147 aa  87.4  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  38.36 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  47.33 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  41.13 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  40.26 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  43.55 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  34 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  40.16 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  40 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  36 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  39.66 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  34.78 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  43.08 
 
 		 125 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  32.26 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 		 424 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  25.88 
 
 		 376 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3740  hypothetical protein  38.6 
 
 		 98 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0154472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  35.53 
 
 		 431 aa  41.2  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4623  hypothetical protein  38.6 
 
 		 98 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 444 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  34.57 
 
 		 449 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>