33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  285  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  52.1 
 
 
174 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  54.05 
 
 
145 aa  140  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  56.46 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  53.42 
 
 
142 aa  137  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  54.84 
 
 
151 aa  128  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  41.38 
 
 
144 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  43.87 
 
 
154 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  51.28 
 
 
131 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  51.16 
 
 
144 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  44.08 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  40.74 
 
 
158 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  44.76 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  42.48 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  40.38 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  39.87 
 
 
159 aa  94.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  43.42 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  43.51 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  43.51 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  43.92 
 
 
166 aa  86.7  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  39.49 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  39.49 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  39.49 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  48.7 
 
 
116 aa  84  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  37.5 
 
 
167 aa  83.6  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  43.84 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  41.73 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  39.61 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  38.4 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  39.37 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  36 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  37.39 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  40.17 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>