37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3330 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  313  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  313  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  313  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  69.81 
 
 
155 aa  200  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  66.67 
 
 
156 aa  188  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  60.58 
 
 
140 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  44.19 
 
 
167 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  42.68 
 
 
158 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  45.4 
 
 
160 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  43.56 
 
 
157 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  38.18 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  37.18 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  39.26 
 
 
158 aa  84  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  36.88 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  40.83 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  39.74 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  39.73 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  38.75 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  39.01 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  39.42 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  38.35 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  38.13 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  31.61 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  37.11 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  34.92 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  39.71 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  33.54 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  34.45 
 
 
131 aa  57.4  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  33.6 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  34.68 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  32 
 
 
134 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4895  RDD domain-containing protein  33.87 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  30.97 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  32.48 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  26.67 
 
 
431 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  32.33 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  28.09 
 
 
217 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>