39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2929 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  85.26 
 
 		 155 aa  229  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  66.04 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  66.04 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  66.04 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  61.87 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  44.38 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  47.83 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  44.17 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  42.95 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  45.75 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  43.29 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  43.11 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  43.66 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  42.04 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  40 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  39.73 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  40.52 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  42.21 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  37.86 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  38.13 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  39.6 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  32.89 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  34.62 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  34.92 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  37.21 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  36.65 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  35.09 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  37.8 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  35.77 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  36.28 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  31.2 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4895  RDD domain-containing protein  36.59 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3567  RDD domain-containing protein  36.29 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  29.27 
 
 		 431 aa  44.3  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  32.65 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  30.46 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  31.79 
 
 		 397 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2564  signal peptidase I  26.88 
 
 		 498 aa  40.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.57183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>