27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2296 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  288  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  36.21 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  38.26 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  36.92 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  35.88 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  38.98 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  33.06 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  40.48 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  35.65 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  38.18 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  30.95 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  35.37 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  35.71 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  36 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  30 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  37.01 
 
 		 156 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  34.68 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  34.68 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  34.68 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  35.83 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  33.07 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  35.97 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  33.86 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  33.33 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  32.54 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  32.26 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3567  RDD domain-containing protein  32.37 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>