42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2630 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1263  RDD domain-containing protein  67.11 
 
 		 152 aa  201  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0359346  normal  0.130188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3101  RDD domain containing protein  53.75 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0763481  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1601  RDD domain-containing protein  50.33 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  47.95 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2111  RDD domain containing protein  43.75 
 
 		 174 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0933  RDD domain containing protein  44.9 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0924  RDD domain-containing protein  54.39 
 
 		 116 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15380  hypothetical protein  47.2 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7409  RDD domain containing protein  42.19 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  48.33 
 
 		 131 aa  101  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2037  RDD domain containing protein  45.11 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.905521  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16400  hypothetical protein  37.58 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.428616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0926  RDD domain containing protein  42.04 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3290  RDD domain containing protein  43.65 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  44.8 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2929  RDD domain-containing protein  42.96 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1483  RDD domain containing protein  39.24 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3331  RDD domain-containing protein  42.74 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00294231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12248  hypothetical protein  44.78 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300466  normal  0.915257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3584  RDD domain-containing protein  38.03 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0783215  normal  0.0483583 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13390  hypothetical protein  34.38 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.408767  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16490  hypothetical protein  36.81 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1916  RDD domain containing protein  40.91 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0253441  hitchhiker  0.000670686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3330  RDD domain-containing protein  38.35 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.177645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3319  RDD domain-containing protein  38.35 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.436382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3381  RDD domain-containing protein  38.35 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0851083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3567  RDD domain-containing protein  42.86 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1511  RDD domain containing protein  39.1 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3079  RDD domain containing protein  33.54 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0151194  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3372  RDD domain containing protein  42.52 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  46.09 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07510  hypothetical protein  36.42 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.38358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4895  RDD domain-containing protein  32.8 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2296  RDD domain-containing protein  30.95 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  27.92 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  26.62 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  47.95 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  23.29 
 
 		 154 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  35.07 
 
 		 274 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  31.03 
 
 		 175 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  33.6 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>